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Characterization of the Fecal Microbial Communities of Duroc Pigs Using 16S rRNA Gene Pyrosequencing
Duroc Pigs Fecal Microbiota 16S rRNA Gene Pyrosequencing
2016/5/18
This study characterized the fecal bacterial community structure and inter-individual variation in 30-week-old Duroc pigs, which are known for their excellent meat quality. Pyrosequencing of the V1–V3...
Rapid Origin Determination of the Northern Mauxia Shrimp (Acetes chinensis) Based on Allele Specific Polymerase Chain Reaction of Partial Mitochondrial 16S rRNA Gene
Allele-specific Polymerase Chain Reaction Origin Identification
2016/5/18
Acetes chinensis is an economically important shrimp that belongs to the Sergestidae family; following fermentation, A. chinensis′ economic value, however, is low in China, and much of the catch in Ch...
利用韩国豹猫的IRBP、12S rRNA 和细胞色素b (Cyt b)序列,并将其与GenBank 中的豹猫及西表猫的上述基因进行比较,以此来重新分析韩国豹猫和其它豹猫及西表猫之间的遗传分化情况。首先,我们从18 只韩国豹猫的IRBP、12S rRNA 和Cyt b 序列分析中分别检测到6 个等位基因、1 个单倍型和3 个单倍型,推测曾经发生在豹猫种群的瓶颈事件可能是本文发现的不同分子标记之间存在...
鲟形目线粒体16S rRNA的部分序列变异及系统发生
鲟形目 线粒体DNA 16S rRNA 系统树
2012/11/21
采用通用引物对3种鲟形目（Acipenseriformes）鱼类，中华鲟（Acipenser sinensis）、俄罗斯鲟（Acipenser gueldenstaedtii）和匙吻鲟（Polyodon spathula）的16S rRNA基因部分片段进行扩增，并与NCBI数据库中获得另外6种鲟形目鱼类相应的16S rRNA序列部分进行比较，探讨鲟形目2个科5个属共9个种之间的遗传变异和亲缘关系....
基于16 S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
角蟾科 16 S rRNA 系统发育 拓扑结构
2009/6/23
采用最大似然法(ML法)、最大简约法(MP法)、邻接法(NJ法)对来自角蟾科Megophryidae (Anura)8属17种及外群2种共25条400 bp左右的线粒体16 S rRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明，用于分析的所有角蟾科物种形成两大支，第一支包括Megophrys，Brachytarsophrys和Atympanophrys，第二支包括Leptobrachium，Leptol...
中国沙塘鳢属鱼类线粒体12S rRNA基因序列分析
沙塘鳢属 线粒体12S rRNA基因 分子系统学 生物地理学
2009/5/31
沙塘鳢属鱼类为东亚特有的小型淡水经济鱼类，中国产沙塘鳢属鱼类分类问题长期存在争议。本文测定了
中国产沙塘鳢属鱼类全部种类的线粒体12S rRNA基因部分序列，结合GenBank中下载的2种日本沙塘鳢属鱼类和
塘鳢科鱼类同源序列，探讨中国产4种沙塘鳢属鱼类的物种有效性，分析沙塘鳢属鱼类的系统发育关系。作者所
使用的同源序列长度为690bp，其中变异位点258个，简约信息位点201个，包括插入／...
用mtDNA 12S rRNA序列变异检验鲤形目鱼类系统发育关系
鲤形目 12S rRNA 系统发育
2008/1/31
摘要通过对鲤形目鱼类5个科的代表类群的完整线粒体12S rRNA进行测序和分析，以检验目前的形态学假说。经序列比对后，有1 000个位点，其中467个位点在茎区，533个在环区；有395个位点为变化位点，其中267个为系统发育信息位点。采用邻接法和最大简约法进行了系统发育分析，其结果支持鲤科鱼类成为一个单系群，非鲤科的鲤形目鱼类成为另一个单系群的观点，这与Siebert 提出的假说相一致。鲤科鱼类...
双壳纲动物核糖体RNA 18S-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and its Application in Phylogenetic Analysis
ITS1 18S RNA 遗传多样性 双壳纲
2008/1/20
摘要
测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明，该序列在种间存在很高的多态性，长度从558 bp到784 bp不等，碱基差异百分比在10.7%~61.7%之间， ITS1序列同源性很低，有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9%~23.7%之间，变化主要是碱基的转换。用邻接法（NJ）构建了8个种的18S部分序列（约240 bp...
摘要采用质粒克隆测序方法，获得了异源四倍体鲫鲤5个个体、异源四倍体鲫鲤雌核发育二倍体后代2个个体、三倍体湘云鲫2个个体及红鲫、湘江野鲤和日本白鲫各1个个体的线粒体DNA 12S rRNA基因的全序列。经对比发现，异源四倍体5个个体共享2种单元型，异源四倍体鲫鲤雌核发育二倍体后代2个个体、三倍体湘云鲫2个个体以及红鲫、湘江野鲤和日本白鲫各1个个体分别共享1种单元型。用MEGA 1.0 软件分析了它们...
Identification and Comparison of the Nucleotide Sequence of 16S-23S rRNA Gene Intergenic Small SR(Spacer Region) of Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103 with Those of L. casei, L. acidophilus and L. helveticus
16S-23S Intergenic Spacer Region Identification L. rhamnosus
2016/4/14
Reliable PCR based identification of lactobacilli has been described utilizing the sequence of 16S-23S rRNA intergenic spacer region. Those sequence comparisons showed a high degree of difference in h...