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本试验旨在采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析瘤胃菌群在不同纤维素富集条件下的多样性。试验采用羧甲基纤维素(CMC)培养基、蛋白胨纤维素(PCS)培养基、J培养基和K培养基分别在37和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用PCR-DGGE技术、DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序、聚类分析和主成分分析(PCA)几种方法分析瘤胃菌群多样性。结果表明:37℃条件下,不同培养基...
患病与健康虾夷马粪海胆(Strongylocentrotus intermedius)体腔液菌群的PCR-DGGE分析比较
虾夷马粪海胆 体腔液 16S rDNA PCR-DGGE 疾病
2012/2/16
分析比较患病与健康虾夷马粪海胆体腔液菌群的PCR-DGGE指纹图谱,并通过切胶、克隆测序等步骤分析患病虾夷马粪海胆体腔液中的特异菌群。结果显示,健康海胆体腔液中菌群的PCR-DGGE指纹图谱具7个条带,其中有5个与患病海胆相同,2个为不同条带,表明健康海胆体腔液中至少含7种细菌,其中2种以上细菌随机体环境变化而消亡；患病海胆具11个条带,其中包括6条特异条带并分别对应单一细菌,包括1个鞘氨醇单胞菌...
为了了解发酵全混合日粮(TMR silage)发酵过程中的乳酸菌的菌种变化，应用MRS琼脂培养基对新鲜啤酒糟和豆腐渣以及它们的发酵TMR（贮存0、14和56 d）的乳酸菌进行培养，所得的可培养乳酸菌应用PCR-DGGE进行筛选，对菌体DNA的碱基序列进行测定，在GenBank上检索相近的16S rDNA序列对其鉴定。结果表明：2种原料中的乳酸菌种类完全不同；加入相同的其他材料变成TMR后，优势乳酸...
本文旨在采用ERIC-PCR和PCR-DGGE方法研究肉鸡喂服枯草芽孢杆菌后肠道菌群的多样性。选用15羽28日龄肉鸡，按2 mL/kg BW喂服枯草芽孢杆菌悬液(109 CFU/mL)，每天2次，连续3 d，34日龄时，利用ERIC-PCR和PCR-DGGE方法分析肠道菌群的多样性，并对DGGE条带进行回收、测序。结果表明，肉鸡口服枯草芽孢杆菌后各肠段的条带数显著多于对照组（P<0.05或P<0....